Magic Keyboadを装着したiPad Pro12.9は、iPag14 SHINOBI モデルをおすすめいたします。

最新版のiPad Pro12.9＋Magic Keyboadの場合、
実測約280×228×15mm（幅×奥行き×高さ）あるようです。

■13 SHINNOBI yoko［ヨコ］の場合
サイズ(内寸）：223mm（高さ）×308mm（幅）×14mm（厚さ）なので、
横に収納した時、5mmほど本体が上に出てしまいます。
Apple Pencilがマグネットで付けるとさらに飛び出てしまいますので、
iPag付属のApple Pencilホルダーを使って、横の隙間にApple Pencil収納できます。

本体が飛びだたせたく無い場合はこちら
■iPag14SHINOBI  yoko［ヨコ］の場合
サイズ(内寸）：230mm（高さ）×326mm（幅）×14mm（厚さ）
なので、横に収納した時、2mmほど小さいですが、最新版のiPad Pro12.9は
横にマグネットでApple Pencilが装着できるタイプですが、飛び出してしまいますので
iPag付属のApple Pencilホルダーを使って、横の隙間にApple Pencil収納できます。

タテに収納して持ち運びたい場合、
■iPag14SHINOBI  tate［タテ］の場合
サイズ(内寸）：330mm（高さ）×241mm（幅）×14mm（厚さ）なので、
Apple Pencilを横にマグネットで装着したままでも収納可能です。

■13 SHINNOBI  tate［タテ］の場合
サイズ(内寸）：315mm（高さ）×225mm（幅）×14mm（厚さ）なので
Magic Keyboad装着するとiPad Pro12.9は収納できないということになります。